Mikrobiológia

BoFU-80: Ultrahanggal támogatott MALDI-TOF azonosítás Rhizopus oryzae

Rhizopus oryzae általában a talajban, a levegőben és más anyagokban létezik. Fontos penész az élelmiszer-erjesztésben, mert élelmiszer-bomlást okozhat. Kolóniája laza vagy sűrű, amely kezdetben fehér, majd szürkésbarnából feketebarnára változik. A hamis gyökerek jól fejlettek, ujj- vagy gyökérszerű elágazásúak, és tipikus fonalas gombák, amelyeket nehéz áttörni. A fehérjét a Bruker által ajánlott és MALDI-TOF-val azonosított standard hangyasav-extrakciós módszerrel extraháltuk, de nem találtak nyilvánvaló markercsúcsot, és nem lehetett kimutatni. A sejtfal feltörésére és extrakciójára szolgáló reagenskészlet használata után három jellegzetes csúcsot azonosítottak, de nagy volt a zaj, és a csúcs tömegaránya (m/z) kevesebb, mint 200 volt.

A BoFU-80 nagyfrekvenciás fókuszált ultrahangrendszert használ az akusztikus energia koncentrálására a feldolgozandó mintába, ami hatékonyan javíthatja a törzs fehérjeextrakciós sebességét és növelheti a MALDI-TOF rendszer kimutatási sebességét. Fókuszált ultrahanggal és reagenskészlettel a fehérje kivonására a MALDI-TOF kimutatásához hat markercsúcsot kaptunk, amelyek csúcs-tömegaránya (m/z) meghaladta a 400-at, és 9,169-es pontszám nagy megbízhatóságot jelez.