Könnyen használható előregyártott DNS-puffer: nincs hígítási zavar, nincs hűtés, csak 5 perces gélek

Mi az egy könnyen használható előre gyártott DNS puffer? Ez egy DNS puffer-technológia, amely lehetővé teszi, hogy a lehető legtöbb időt spórold meg, és ne okozz további problémákat a fárasztó munkaterhelésedben. Sok kereskedelmi "gyors" puffer gyors szétválasztást ígér, de saját kihívásokat is behoz: bonyolult hígítási lépések, kötelező hidegtárolás és megkérdőjelezhető kompatibilitás az alsóbb alkalmazásokkal.

A Longlight Technology tervezte a 50-szeres szupergyors futópuffer hogy elkerüljük ezeket a buktatókat. Az eredmény egy alacsony ionerősségű agarópuffer, amely a tipikus 30 perces futamokat 5–10 percre csökkenti, anélkül, hogy speciális kezelést vagy bonyolult előkészületeket igényelne.

Az alábbiakban világos összefoglalót találunk arról, miért teszi ezt a könnyen használható előregyártott DNS-puffert valóban praktikussá mindennapi labormunkához.

A technikai alap: alacsony ionerősség, kevesebb hő

A standard 1X TAE és TBE pufferek viszonylag magas ionerősséggel rendelkeznek. Amikor a feszültség nő, a Joule hőmérséklet hirtelen megemelkedik, ami sáv elmosódását, kúttorzulást és következetlen migrációt eredményez. Egy könnyen használható előregyártott DNS-puffer lehetővé teszi a magasabb feszültségeket ezek nélkül a mellékhatások nélkül. Az alacsony moláritású vezető közegek bizonyított megoldást kínálnak.

Olyan kutatók, mint Jonathan R. Brody, Eric S. Calhoun, Eike Gallmeier, Talisa D. Creavalle és Scott E. Kern a Johns Hopkins Egyetem Orvostudományi Karán, kimutatták, hogy az ionkoncentráció csökkentése hatékonyan csökkenti a hőtermelést. Munkájuk kimutatta, hogy az alacsony moláritású közegek "csökkentik az elektroforetikus rendszer Joule-felmelegedését, és lehetővé teszik a DNS töredékek könnyen használható, ultra-gyors szétválasztását."

Singhal, Ren és Kern korábbi eredményei a Johns Hopkins-nál (2010) megerősítették, hogy az alacsonyabb vezetőképességi feltételek gyorsabb futási sebességet és élesebb sávelválasztást eredményeznek a fragmentumok esetében, amelyek egyetlen gélben 100 bp-től 12 kb-ig terjednek.

Javított DNS-elektroforézis

A poliborátok és a Lewis-sav komplexációját kedvező feltételek | PLOS One

A Longlight Technology ezt az elvet közvetlenül alkalmazta az 50X Super Fast Running Bufferre. Az ionos terhelés alacsony tartásával a puffer akár 30 V/cm feszültséget is lehetővé tette, miközben megtartja a felbontást. Ez a lényeg egy valóban könnyen használható előregyártott DNS puffer mögött, amely kompromisszummentes sebességet biztosít.

Miért csökkenti ez a puffer a mindennapi labor súrlódását

Egy praktikus könnyen használható előregyártott DNS puffernek három gyakori problémát kell egyszerűsítenie: hígítási hibákat, tárolási logisztikát és munkafolyamat-megszakításokat. Íme, hogyan kezeli az 50X Super Fast Running Buffer mindegyiket.

• Hígítási zavar hiánya: hígítsd az 50X koncentrátumot 1:50-re desztillált vízzel, hogy 1X működő oldatot kapjunk. Nincs pH-állítás, nincs plusz számítás. Használd ugyanazt az 1X puffert a gél dobáshoz és futáshoz, hogy az ionikus erő egyenletes maradjon.

• Nincs szükség hűtésre: Mind az 50X alap, mind a hígított 1X puffer legalább 12 hónapig stabilan marad szobahőmérsékleten. A laborok puffereket tárolhatnak a padon, így hideg helyet szabadítanak fel enzimek és antitestek számára.

• Nincs várakozás a gélekre: Az alacsony hőfokú kialakítás 25–30 V/cm tartományt támogat. Egy általában 30 perc elválasztás 5–10 perc alatt ér véget. Ez növeli az átbocsátási sebességet azoknak a laboroknak, amelyek naponta sok mintát dolgoznak fel.

• Nincs szükség szétválasztásra: ez a puffer gélextrakciót és ligációt biztosít. A felhasználók akár a szekvenálást vagy a klónozást is elvégezhetik közvetlenül a szalagvágás és a puffer adagolása után.

•Teljes újrahasználhatóság: A puffer csodálatos pufferkapacitása nem változik a huszonegy futás után. Több pénzt takarít meg, és csökkenti a pufferhasználatból származó hulladékot.

Miért mozdulnak a laborok gyorsabb, egyszerűbb pufferek felé – a piac összehangolása

Az elektroforézis piac várhatóan 2033-ra 4,47 milliárd USD-re nő 2,72 milliárd USD-ről 2024-re. Ez 5,7%-os CAGR-nek felel meg. Ezt a növekedést a genomikai kutatás, molekuláris diagnosztika és a nagy áteresztőképességű szűrés hajtja. Egy könnyen használható előregyártott DNS puffer közvetlenül illeszkedik ebbe a trendbe: a laboroknak gyorsabb átállási időre van szükségük, de olyan módszerekre is szükségük van, amelyek zökkenőmentesen integrálódnak a meglévő munkafolyamatokkal.

Az előkészített agarózzselék már széles körben elterjedtek, mert állandó minőséget biztosítanak és spórolják az öntési időt. Azonban a futó puffer továbbra is kritikus változó. Egy olyan puffer, amely hidegtárolást, összetett hígítást vagy speciális kezelést igényel, lassítja az egész folyamatot. Az 50X Super Fast Running Buffer egyszerűen tartja a dolgokat, miközben lépést tart a modern labor követelményeivel. A sebesség és a használhatóság egyensúlya lehetővé tette a Longlight Technology számára, hogy kifejlessze termékeit.

Beton Laboratórium példák

A könnyen használható előregyártott DNS puffer, ahol jelentős időmegtakarítás érhető el, a következők:

• PCR termékek ellenőrzése: Gyorsan futtatja a megerősítő géleket a PCR termékeken 5-10 perc alatt, ellenőrizze az eredményeket, és döntse el a következő lépésekről a szekvenálás vagy az utólagos alkalmazások során.

• CRISPR vagy digest kísérleti visszajelzés: Gyorsan értékeld az eredményeket, például a szerkesztések vagy digest hatékonyságát, és végezz módosításokat az aznapi kísérletekhez.

• Minőségellenőrzés az NGS könyvtárban: Az NGS könyvtár minőségellenőrzése segíthet elkerülni vagy minimalizálni a hibás szekvenálást az NGS futtatásán.

• Szintetikus biológia: Zárja le a tervezési ciklust konstrukciók szintetizálásával, szerkesztéssel a szekvencia ellenőrzésére, és ennek megfelelően módosításával, anélkül, hogy időt pazarolna az egyes ciklusok között.

• Gyógyszercél-szűrés: Kerüld el a sáv tisztaságának elvesztését nagy áteresztőképességű szűrési kísérletek során azáltal, hogy növeli a nagy minták szűrésének hatékonyságát.

Használat egyszerűsége

Az 50X Super Fast Running Buffer használata lépésről lépésre végezhető, anélkül, hogy tantárgyat kell tanítani.

1. lépés – Készítsd elő az 1X puffert: Adj hozzá 20 ml 50X koncentrátot 980 ml desztillált vízhez, és keverd össze. Az 1X puffer szobahőmérsékleten tárolható.

2. lépés – Öntés és gélek futtatása: Használd ugyanazt az 1X puffert az agarózhoz és az elektroforázishoz. Az agarose gélek 25-30 V/cm hosszában futasd be. A gél nem igényel semmilyen változtatást a festési módszereken.

3. lépés – Nézze meg a gélt és hozzon döntéseket: DNS-foltok bekerülhetnek a gélöntés során, vagy a gél elektroforézis után áztatható a foltban. A szalagok jól láthatóak, és ki lehet vágni őket a későbbi folyamatokhoz.

Összefoglaló

Egy könnyen használható előregyártott DNS puffernek pontosan ilyen kell, hogy legyen: könnyen hígítható, könnyen tárolható, és könnyen integrálható a meglévő munkafolyamatokba. A Longlight Technology 50X Super Fast Running Buffer mindhárom megoldást eléri. A hőtermelés minimalizálásával 30 percről 5–10 percre csökkenti a futási időt, ugyanakkor nem igényel hűtést, bonyolult kezelést és további takarítási lépéseket. Azoknak a laboroknak, amelyek egyszerre értékelik a sebességet és a megbízhatóságot, ez a buffer egyszerű frissítést kínál.

További információért, árajánlatkérésért vagy rendelés letételéért látogasson el www.longlight.com vagy közvetlenül a Longlight Technology csapatával kapcsolatba lép.

GYIK

K: Valóban egy könnyen használható előre gyártott DNS-puffer az 50X Super Fast Running Buffer?

V: Mindenképp. Nincsenek bonyolult hígítási számítások vagy pH-módosítások. Emellett nem szükséges hűtés is. Csak hígítsd 50-szer lepárolt vízben 1:50-re, hagyd pihenni az RT-nél, és készen áll az 5 perces gél futásokra!

K: Újrahasználható ez a puffer?

V: Abszolút! A puffer erős pufferelőkapacitása miatt ugyanaz az 1X működő megoldás többször is használható, csökkentve a hulladékot és a kísérletenkénti költséget!

K: A puffered azt állítja, hogy kompatibilis különböző elektroforézis- és festési rendszerekkel. Ez tényleg így van?

V: Igen! Ezt a puffert 1X-ként is használhatod mind a gélhez, mind a futtatáshoz. A gélt a DNS-festékkel öntheted, és utána áztathatod a festéshez. Személyre szabhatod a dizájnodat, ahogy csak akarod!

K: Árt a könnyen használható előregyártott DNS puffer a ligációnak vagy a gél extrakciónak?

V: Határozottan nem! Levághatod a kívánt szalagokat, és elvégezheted a szekvenálást extra tisztítás nélkül!

K: Maradhat ez a buffer 12 hónapig az RT-n?

V: Igen. Mind az 50X puffer, mind az 1X előkészített puffer stabil RT állapotban 12 hónapig. Nem kell aggódnod a puffer hideg miatt!